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产物挑选指南

K7

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自动化下通量的单细胞程度人T细胞受体剖析
品牌 Code No. 包装量 价钱 说明书 数目
Wafergen 640178 1 Chip 询价 716.com
Wafergen 640179 1 Chip 询价
Wafergen 640180 5 Chips 询价
Wafergen 640181 10 Chips 询价
Wafergen 640182 Each 询价
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SMARTer® ICELL8® Human TCR a/b Profiling系列—
下通量天说明单细胞中T细胞受体Alpha-Beta链多样性
· 灵敏性更高:基于RACE手艺包管低丰度TCR变体的检出
· 特异性更强:得到全长reads,目标reads占比高,更正确的配对信息
· 5’端捕捉测序差别表达剖析:经由过程比对5’末尾信息,发生一切转录本差别表达数据
· 天真、下通量的单细胞剖析:单次实行同时剖析8个样品,天生上千单细胞的测序数据
 
■ 应用领域
· 人单细胞TCR库剖析(TCRα和TCRβ克隆型)
· 5’端差别表达剖析
 
■ 产物阐明
Takara Bio下通量TCR库解决方案联合SMART手艺(Switching Mechanism at 5’End of RNA Template)和相似5’RACE的要领,用于捕捉由SMARTer ICELL8体系分选获得的上千“活的单细胞”TCR转录本的悉数V(D)J可变地区。发生的文库可同时包罗α链和β链的多样性信息。
实行流程中,cDNA扩增阶段整合了illumina特异的讨论序列,构建的文库带有illumina Indexes,可间接用于illumina平台测序。与此同时,也支撑您停止5’末尾差别表达剖析。需求注重的是,凭据您所挑选的单细胞分选平台(SMARTer ICELL8 Single-Cell System大概SMARTer ICELL8 cx Single-Cell System),实行流程需求挑选对应的芯片和collection kit。
正在SMARTer ICELL8体系上,取单个T细胞一同被分注到TCR芯片上的另有阳性对比和阴性对比。每一个TCR芯片含有5,184个纳晋级微孔,预制了1,728个特其余Barcode,同时每一个Barcode正在芯片上被预制了3次。正在用CellSelect软件审定出了具有“活的单细胞”微孔后,SMART RT-PCR试剂能被分注到那些被选中为“活的单细胞”的微孔中,用于后续剖析。候补孔中带Barcode的cDNA能正在芯片上完成PCR扩增,接着将带Barcode的全长扩增子一同从芯片上收集下来。纯化后的cDNA作为第一轮TCR特异性PCR的模板,而第一轮TCR特异性PCR的产品作为第二轮TCR特异性PCR的模板,并整合illumina indexed primer。
 
■ 产物组分
完好的实行流程需求以下产物:
· SMARTer ICELL8 TCR Chip (Code No. 640178)
· SMARTer ICELL8 Human TCR a/b Profiling Reagent Kit (Code No. 640182)
· SMARTer ICELL8 Collection Kit (Code No. 640048)
· SMARTer ICELL8 Loading Kit (Code No. 640109)
· SMARTer ICELL8 Human TCR a/b Profiling - Indexing Primer Set
   (Code Nos. 640179, 640180 & 640181)*
 
* 640179包罗的Primer量充足1张芯片运用,若您单次实行运用多张芯片,请购置适宜的indexing primer set。640180适用于5张芯片的实行,640181适用于10张芯片的实行。
 
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图1 SMARTer ICELL8 Human TCR a/b profiling手艺道理流程图
 
图2 SMARTer ICELL8 Human TCR a/b profiling实行流程图
 
图3 接纳ICELL8平台对用十四烷酸乙酸大戟二萜醇酯(PMA,phorbol myristate acetate)处置惩罚和未处理的CCRF-CEM细胞停止单细胞分选及后续单细胞TCR剖析,效果显现PMA处置惩罚能增添TCRα克隆型的数目
 
 
产物详情请接见以下英文网页:
 
视频材料:自动化下通量的单细胞程度剖析人T细胞受体(TCR)库
Takara Bio USA公司Dr. Sarah Taylor和Thomas Schaal议论如安在自动化下通量单细胞分选体系SMARTer ICELL8 Single-Cell System剖析上千单细胞TCR α链和TCR β链克隆型,以得到TCR多样性数据。